Desde que se abrió como centro de servicios en junio 2005 el CEGEN ha dado servicio a numerosos grupos de investigación. Ver proyectos finalizados. La práctica totalidad de estos proyectos se han llevado a cabo, en parte, mediante herramientas diseñadas por el Instituto Nacional de Bioinformática (INB) para el CeGen. SYSNPs permite facilitar el diseño de estudios de asociación y la posterior anotación de resultados. SNPator facilita el control de calidad de los datos y la realización de estudios de asociación.
| Titulo |
IP |
Institución |
Metodología |
| |
| Factores Geneticos en los transtornos |
Yolanda de Diego Otero |
Fundacion IMABIS |
Sequenom iPlex-Gold Custom Oligos, |
| |
Aspectos genéticos -poblacionales y transición nutricional en el Noroeste de Argentina
|
María Soledad Mesa Santurino
|
Universidad Complutense de Madrid |
Illumina Veracode |
| |
| Reproduction and Epigenetics |
Agustin Fernadez Enrique Roche Carlos Lopez Otin |
Universidad Miguel Hernández.
Universidad de Oviedo
Instituto de Bioingeniería |
Illumina Infinium Human Methylation27 |
| |
Caracterización morfológica y molecular de variedades y clones de vid
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Javier Ibañez |
Ciencias de la Vid y el Vino |
SNPlex Custom Oligos |
| |
| Genotipat Custom |
Amalia Martinez-Mir |
Universidad de Sevilla |
Veracode Illumina |
| |
| Aspectos Genéticos poblacionales y transición nutricional en Noroeste de Argentina |
María Soledad Mesa |
Universidad Complutense de Madrid |
Cuantificación por Picogreen,Veracode Illumina Custom Oligos |
| |
PI081536
|
Jose Carlos Gonzalez Piqueras |
Fundación Hospital Clínico Universitario de Valencia |
Sequenom iPlex-Gold Custom Oligos
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| |
| Genotipado de variantes del cancer |
Begoña Graña |
FPGMX |
Sequenom iPlex-Gold Custom Oligos
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| |
Obesidad, Insulino resistencia e intolerancia a la glucosa
|
Manuel Serrano Ríos |
Hospital Clínico San Carlos |
Sequenom iPlex-Gold Custom Oligos
|
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| Genotipado Illumina Omni1 |
Jordi Sunyer |
Fundació CREAL
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Illumina Infinium HumanOmni1-Quad
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Genotipado 96 muestras INMA con xip Omni-1
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Xavier Estivill |
CRG |
Illumina Infinium HumanOmni1-Quad
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| |
| SNPsEICAS |
Sergi Mas Herrero |
Fundacio Clnic per a la Recerca Biomdica
|
Sequenom iPlex-Gold Custom Oligos |
| |
Cuantificacin por Picogreen,Illumina Infinium HumanOmni1-Quad
|
Xavier Estivill |
CRG |
Cuantificacin por Picogreen,Illumina Infinium HumanOmni1-Quad
|
| |
Hepatitis C en pacientes coinfectados por VIH/VHC: influencia de los polimorfismos genéticos de un solo nucleótido 2
|
Salvador Resino García
|
Instituto de Salud Carlos III |
Sequenom iPlex-Gold Custom Oligos |
| |
| Bases genéticas de la Malformación de Chiari Tipo I |
Alfons Macaya Ruiz |
Institut de Recerca Hospital Universitari Vall d'Hebron |
Cuantificacin por Picogreen,Veracode Illumina Custom Oligos |
| |
Análisis de metilación de muestras de pacientes con cáncer
|
Manel Esteller |
Fundaci Institut d'investigaci biomdica de Bellvitge
|
Cuantificacin por Picogreen,Illumina Infinium Human Methylation27
|
| |
| Hepatitis C en pacientes coinfectados por VIH/VHC: influencia de los polimorfismos genéticos de un solo nucleótido |
Salvador Resino
|
Centro Nacional de Microbiología |
Illumina Veracode Custom Oligos |
| |
| Identificación de locus causante del fenotipo |
Lluis Montoliu |
Centro Nacional de Biotecnología |
Illumina GoldenGate Linkage Mapping en Ratn (Alta Densidad)
|
| |
| Arquitectura Molecular y variación de regiones funcionales y no funcionales del genoma humano |
Pedro Moral Casrillo |
Biología Animal -Antropología |
Illumina Veracode |
| |
| Panel SNPs CTFRII |
Francisco Barros |
|
Sequenom Iplex Gold |
| |
| Mejora asistida para marcadores en tomate |
Antonio Monforte |
Biotecnología y Mejora Vegetal de Especies |
Veracode Illumina Custom |
| |
| FINE MAPPING |
Sergi Castellví Bel |
Fundacio Clinic per la Recerca Biomedica |
Sequenom Iplex-Gold Custom Oligos |
| |
| HIWATE 384 SNPs 1373 mostes |
Xavier Estivill, Mariona Bustamante |
Centre de Regulació Genòmica |
Veracode |
| |
| Caracterización de los patrones de metilación en leucemias (parte 2) |
Manel Esteller |
Fundació IDIBELL |
Illumina Infinium MEthylation 27 |
| |
| Caracterización de los patrones de metilación en leucemias (parte 1 y 2) |
Manel Esteller |
Fundació IDIBELL |
Illumina Infinium Methylation |
| |
| bases moleculares de cardiopatías congénitas (parte 2) |
Damia Heine Suñer |
Fundació Mateu Orfila |
Illumina Infinium Human 660W |
| |
| GEN CIDI (transtornos afectivos) |
Marta Torrens |
IMIM |
Illumina |
| |
| Avaluació PSV |
Luis Pérez Jurado |
Fundació PRBB |
Illumina Custom Oligos |
| |
| GRECOS |
Israel Fernández Cadenas |
Fundació Institut de Recerca de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron |
SNPlex |
| |
| Estudio de polimorfismos de cáncer de mama parte 2 |
Roger Milne |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
S09-0305 milne mama2 |
| |
| Estudio de polimorfismos de cáncer de mama parte 1 |
Roger Milne |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Veracode |
| |
| Cáncer de vejiga |
Santiago Ropero |
Fundación para la Investigación Biomédica Hospital Universitario de Getafe |
MEtilación GoldenGate |
| |
| Interlequines |
Núria Sala, Xavier Muñoz |
Fundació IDIBELL |
Veracode |
| |
| Interlequines |
Nuria Sala, Xavier Muñoz |
Fundació IDIBELL |
Veracode |
| |
| Array de 1M SNP para localizar genes de Anemia de Fanconi |
Jordi Surralles Calongue |
Universitat Autònoma de Barcelona, Ciber en Enfermedades Raras |
Illumina WGS 1M |
| |
| mtSNP screening de genomas mitocondriales completos |
Antonio Salas Ellacuriaga |
CIBER en enfermedades raras |
Iplex Sequenom custom oligos |
| |
| Identificación de potenciales genes supresopres de tumores en neoplasias linfoides |
Pedro Jares
|
Fundació Clínic per a la Recerca Biomèdica
|
Cuantificación por Picogreen,Illumina Infinium Human Methylation27 |
| |
| desarrollo de un array de DNA para diagnóstico |
Miroslava Ogorelkova |
Gendiag.exe S.L. |
PCR Cuantitativa (Sondas Taqman) Custom Oligos
|
| |
| nsSNPs en esquizofrenia |
Xabier Costas Costas |
Fundación pública galega de medicina xenómica |
Iplex Sequenom |
| |
| Mapeo de factores genéticos de susceptibilidad en enfermedades complejas: aplicación al asma y fenotipos asociados (parte 2) |
Carlos A. Flores Infante |
Fundación Canaria de Investigación y Salud (FUNCIS) |
Sequenom |
| |
Farmacogenómica y screening molecular en linfoma folicular: Evaluación de la tolerancia a fármacos e identificación de nuevas alteraciones genéticas
|
Joaquín Martínez López
|
Hospital Universitario 12 de octubre |
Illumina Infinium Human 1M Duo
|
| |
Genotipado 32M Illumina 1M-duo beadchip
|
Tomasso Dragani |
Fondazione IRCCS Instituto Nazionale Tumori |
Illumina 1M duo beadchip |
| |
| Estudi de la metilació en mostres de cervell |
Xavier Estivill |
Centre Deregulació Genòmica |
Illumina Infinium Methylation27 |
| |
| Illumina GoldenGate Panel I Metilación genes de cáncer |
Santiago Ropero |
Universidad de Alcalá |
La metilación del DNA como herramienta para el diagnóstico, pronóstico y respuesta al tratamiento del cáncer de próstata |
| |
| SNPs SNPlex |
Sergi Castellví Bel |
Fundació Clínic per a la Recerca Biomèdica |
Taqman |
| |
| Detección de deleciones mediante arrays de SNPs |
MAgdalena Ugarte, Lourdes Ruiz |
CIBER en enfermedades raras |
Illumina Infinium 610S |
| |
| Análisis alteraciones cromosómicas eon array 6,0 |
Francisco Barros |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
Affymetrix Genome-wide HumanSNP array 6.0 |
| |
| Cronificación del dolor tras cirugía de hernía inguinal, histerectomía y cardiotorácica |
Antonio Montes Pérez |
Fundació IMM |
Barcelona SNPlex |
| |
| Genes de reparación |
Gloria Ribas |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Genes candidatos y dieta mediterranea (parte 2) |
Federico Soriguer, Sonsoles Morcillo |
Fundación IMABIS |
Iplx Gold Sequenom |
| |
| Aproximación a la correlación genotipo-fenotipo y determinación de bases moleculares de las cardiopatías congénitas y del síndrome del22q11.2 |
Damian heine suñer |
Fundació Mateu Orfila |
Illumina 660W |
| |
| Genotipado masivo para la caracterización genética de pacientes con melanoma cutáneo esporádico en población española |
Gloria Ribas |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Genotipado kit identificación vid |
José Miguel Martínez Zapater |
Centro Nacional de Biotecnología |
SNPlex |
| |
| SNPs ibéricos en rabidpsis (fase 12) |
Carlos Alonso Blanco |
centro Nacional Biotecnologia |
SNPlex |
| |
| Analisis de metilacion global de genoma MEDIANTE TECNOLOGIA ILLUMINA (fase 4) |
Manel Esteller |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Illumina Panl I MEtilación Golden Gate
|
| |
| Genes expresados diferencialmente en los dos hemisferios cerebrales como candidatos al trastorno por déficit de atención con hiperactividad (TDAH). Parte 2. |
Mònica Bayés |
Centre de Regulació Genòmica |
SNPlex |
| |
| Diversidad, diferenciación y estructura genética de poblaciones naturales de Arabidopsis Thaliana |
Xavier Picó |
Estación biológica de Doñana |
SNPlex |
| |
| Arabidopsis pruebas |
Carlos Alonso Blanco |
Centro Nacinal de Biotecnología |
SNPlex |
| |
| TDA réplica2 |
Mònica Bayés |
Centre de Regulació Genòmica |
Veracode |
| |
| Búsqueda de biomarcadores utilidad farmacogenétic |
Francisco Barros Angueira |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
WGS Santiago Affymetrix WGS |
| |
| Cancer colon fase II |
Angel Carracedo, Clara Ruiz Ponte |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| PSE_IMID_KIT 610Quad (fase II) |
Sara Marsal |
Institut de Recerca de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron |
Illumina WGS 610 Quad |
| |
| Genotipado 260 muestras array 20K CSNPs |
Alfonso Castro García |
Fundación IDICHUS |
Affy human panel 1-2 20K |
| |
| Genotipado 48 muestras affy human panel 1-2 20K |
Mª Jesús Sobrido |
Fundación Pública Galega de Medicina genómica |
Affymetrix human panel 1-2 20K |
| |
| Cormand neurológiques8 |
Bru Cormand |
Universitat de Barcelona |
Taqman |
| |
| Caracterización molecular u estudio de las enfermedades mieloproliferativas crónicas phi negativas clásicas |
Joaquín Martínez López |
Universidad Complutense de Madrid
|
Illumina Infinium Metilación-27 |
| |
| VULNERABILIDAD GENETICA A LAS ALUCINACIONES AUDITIVAS EN PSICOSIS |
Julio Sanjuan Arias |
Universidad de Valencia |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Estudio de asociación del gen de la galanina y receptores de galanina con el transtorno obsesivo compulsivo (parte 2) |
José Manuel Menchón Magriñá |
CIBERSAM |
Veracode |
| |
| Estudio de asociación del gen de la galanina y receptores de galanina con el transtorno obsesivo compulsivo |
José manuel Menchón Magriñá |
CIBERSAM |
Veracode |
| |
| European Network to promote research into uncommon cancers in adult and children: pathology, biology and genetics of bone |
Carlos Mackintosh |
Centro de Investigación del Cáncer de sSlamanca |
infinium methylation-27 |
| |
| Ploidía y regulación transcripcional de genes localizados en regiones cromosómicas alteradas de manera recurrente como base biológica de las diferencias en comportamiento clínico del neuroblastoma |
Cinzia Lavarino |
Fundació Sant Joan de Déu de Barcelona |
Illumina infinium methylation-27 |
| |
| Farmacogenómica y farmacogenética de la migraña: Análisis de genes candidatos farmacogenómica de migraña segunda fase setB |
Mª Jesús Sobrido |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Farmacogenómica y farmacogenética de la migraña: Análisis de genes candidatos farmacogenómica de migraña segunda fase setA |
Mª Jesús Sobrido |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
iplex Gold Sequenom |
| |
| Farmacogenómica y farmacogenética de la migraña: validación de asociación de polimorfismos en farmacogenética de la migraña |
María Jesús Sobrido |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Farmacogenómica y farmacogenética de la migraña: Réplica de SNPs específicos en genes de canales iónicos |
Mª Jesús Sobrido |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Farmacogenómica y farmacogenética de la migraña: Estudio de replicación ruta dopaminérgica |
Mª Jesus Sobrido |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
iplex Gold Sequenom |
| |
| Ovarian Cancer Genome |
Giuseppe Viglietto |
BIOGEM ScarI |
Illumina 610Quad |
| |
| Efecto de la exposición a diferentes tóxicos en los niveles de metilación del DNA en una cohorte infantil |
Magda Monfort |
CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP) |
Illumina goldengate cancer SNP panel |
| |
| Efecto de la exposición a diferentes tóxicos en los niveles de metilación del DNA en una cohorte infantil (PG08_006) |
Magda Monfort |
CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP) |
Illumina Infinium Metilación-27 |
| |
| Estudio de factores predictores de la respuesta al tratamiento farmacológico en depresión y su correlato con el patrón de expresión génica linfocitaria para genes candidatos (SNC y eje HHA) (SAF 2005-07852-C02-01) |
Lourdes fañanas |
Universitat de Barcelona |
iplex Gold Sequenom |
| |
| SNPs mama |
Ana Vega Gliemmo |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
SNPs mama |
| |
| fisadapt |
Xabier Costas |
Fundación Pública galega de Medicina Xenómica |
Iplex sequenom |
| |
| Meseta central: Y-SNPs |
José Luis Blázquez Caeiro |
Universidad de Santiago de Compostela |
Iplex Sequenom |
| |
| Estudio de cSNPs en enfermedades neurológicas y psiquiátricas (fase 2) |
Ángel Carracedo |
Universidad de Santiago (USC) |
Affymetrix Genechip Human Panel 1 and 2 20K cSNP kit |
| |
| bacground genético para predecir ICTUS |
Joan Montaner |
Institut de recerca hospital de la vall d'Hebron |
SNPlex |
| |
| Análisis de metilación globalde genoma (fase IV) |
Manel Esteller |
centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Illumina |
| |
| SNP mama |
Ana Vega Gliemmo |
Fundación Pública Galega de MEdicina Xenómica |
Affymetrix Genechip Huamn Panel 1 and 2 20K SNP kit |
| |
| CANNABINOIDES NO PSICOACTIVOS COMO POSIBLES AGENTES ANTITUMORALES EN CÁNCER DE MAMA |
Cristina Sánchez García |
Universidad Complutense de Madrid |
Illumina LD377 ratón |
| |
| Análisis de metilación en pacientes con cáncer (fase II y fase III) |
Francisco X. Real |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Illumina infinium methylation |
| |
| Variación genética en vid fase IX |
Jose MIguel Martínez Zapater |
Centro Nacional de Biotecnología |
SNPlex |
| |
| Papel de los factores neurotróficos y de los neurotransmisores serotoninérgicos en los trastornos de la alimentación (fase 10) |
Xavier Estivill, Mònica Gratacós |
Centre de REgulació Genòmica |
SNPlex |
| |
| SNPs de Psoriasis (faseII) |
Xavier Estivill |
Cíber en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP) |
Taqman/Kaspar |
| |
| Genotipado SNPlex muestras psoriasis |
Xavier Estivill |
Ciber en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP) |
SNPlex |
| |
| Variación cuantitativa en la respuesta de Arabidopsis al ácido salicílico |
Pablo Tornero Feliciano |
Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas (UPV-CSIC) |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Metilación illumina |
Manel Esteller |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Illumina Panel I metilación Golden Gate |
| |
| Metilación illumina |
Manel Esteller |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Illumina Infinium Metilación 12 |
| |
| Análisis de SNPs en cáncer de mama |
Javier Benítez |
CIBER en enfermedades raras |
Taqman |
| |
| Aplicación de chips de ADN (arrays) a la identificación de nuevos genes y al diagnóstico de algunas enfermedades genéticas |
Ignacio del Castillo |
Fundación para la Investigación Biomédica del Hospital Ramón y Cajal |
Illumina Infinium WGS 610¡Quad |
| |
| Genotipado Illumina |
Tommaso Dragani |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Illumina HumanHap610 Quad |
| |
| Estudio farmacogenómico de pacientes con transtorno mental grave adictos a opiáceos |
Marta Torrens |
Fundació IMIM |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Estudio metilación infinium fase II |
Mario Fraga |
Centro Nacional Investigaciones Oncológicas |
Metilación infinium Illumina |
| |
| Subestudio farmacocinética, farmacogenómica (parte 2) |
Josep Maria Grinyó i Boira, Nuria Lloberas Blanch |
Universitat de Barcelona |
Taqman/Kaspar |
| |
| Búsqueda de loci relacionados con enfermedades humanas |
Jordi Pérez Tur |
Institut de Biomedicina de Valencia-CSIC |
Affymetrix |
| |
| Metilación en cáncer vesical |
Marta Sánchez-Carbayo |
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas |
Illumina panel 1 metilación |
| |
| Identificación de variantes de número de copia en asma y atiopia |
Xavier Estivill, Raquel Rabionet |
CIBER en epidemiología y salud pública |
SNPlex |
| |
| genotipado cuantitativo de SNPs heterocigotos |
Jorge Ferrer Marrades, Álvaro Roda |
Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Variantes nº de copia en enfermedades neurológicas de elevada prevalencia: aplicación a la migraña y la enfermedad de parkinson |
Eulalia Martí |
Cíber en Epidemiología y Salud Pública |
SNPlex |
| |
| Genotipación de nuevos genes candidatos para la esquizofrenia y depresión |
Lourdes Fañanás |
Universitat de Barcelona |
Iplex Sequenom |
| |
| CCR Galicia |
Clara Ruiz Ponte |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
Affymtrix |
| |
| Aplicación de chips de ADN (arrays) a la identificación de nuevos genes y al dignóstico de algunas enfermedades genéticas: malformaciones congénitas, enfermedades oculares y epilepsias |
carmen Ayuso |
CIBER en enfermedades raras |
Affymetrix |
| |
| Estudio global de asociación del genoma en asma adulta en población europea fase III |
Rquel Rabionet |
Cíber en epidemiología y Salut Pública |
SNPlex |
| |
| Estudio global de asociación del genoma en asma adulta en población europea-fase2 |
Raquel Rabionet |
Cíber en epidemiología y Salut Pública |
SNPlex |
| |
| Estudio de SNPs en cancer de mama (fase 2,2) |
Javier Benítez |
CIBER en enfermedades raras |
Illumina |
| |
| Identificación de cambios genómicos constitucionales responsables de síndromes de sobrecrecimiento y cáncer, y múltiples cánceres. |
María Luisa Martínez-Frias |
CIBER en enfermedades raras |
Illumina |
| |
| Identificación de cambios genómicos constitucionales responsables de síndromes de sobrecrecimiento y cáncer, y múltiples cánceres. |
Javier Benítez |
CIBER en enfermedades raras |
Illumina |
| |
| Estudio global en regiones promotoras en una cohorte infantil expuesta durante el embarazo a niveles elevados de DDT y HCB |
Rafa de Cid |
CIBER en epidemiología y salud pública |
Illuina Custom oligos |
| |
| Réplica cáncer colorectal fase III |
Ángel Carracedo |
Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica |
Iplex Gold Sequenom |
| |
| Parkinson |
Alfonso Castro García |
Fundación IDICHUS. Hospital Clínico Universitario de Santiago |
SNPlex |
| |
| Estudio variantes genéticas en sepsis |
Julián Álvarez |
Hospital Clínico Universitario Santiago |
hME-Sequenom |
