Castellano | English       06/09/10

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Envío Info SNPs

Instrucciones sobre como enviar la información sobre los SNPs a genotipar

 

Para poder realizar el diseño de las sondas de genotipado en cualquier tecnología se requiere o bien el nombre de referencia del SNP, o bien una secuencia de bases mínima (80-150bps) a ambos lados del polimorfismo.

 

Es posible genotipar in/dels en algunas tecnologías. Ver restricciones según tecnología.

 

En el caso de existir SNPs en la región flanqueante al polimorfismo de interés es imprescindible indicarlo ya que puede interferir en el diseño de las sondas. Los SNPs secundarios deben aparecer como "N" en la secuencia.

 

Es imprescindible identificar aquellos SNPs situados en cromosomas sexuales


Preparación de ficheros

 

  » Illumina (Goldengate y Veracode)
  » Affymetrix
  » SNPlex
  » Sequenom (Iplex Gold y hME)
  » Taqman/Kaspar

 

 

 

 

 

     
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