Castellano | English       06/09/10

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Protocolo general de funcionamiento CEGEN

El CeGen es un centro de servicios dedicado principalmente al genotipado de SNPs de alta capacidad. 

Los servicios  disponibles a través del CeGen son para uso exclusivo en proyectos de investigación. 



Quiero genotipar marcadores tipo SNP, ¿Puedo utilizar los Servicios CeGen para el genotipado de mi proyecto?


El primer paso es ponerse en contacto con la Coordinación CeGen, o bien con alguno de los nodos de genotipado. Desde el CeGen proporcionaremos al investigador las indicaciones necesarias para adaptar sus necesidades concretas a la oferta de servicios de las diferentes plataformas tecnológicas.


En función de cada proyecto, desde el CeGen asesoraremos al usuario de nuestros servicios en al selección la plataforma tecnológica más adecuada a sus necesidades.


Hay diversos factores que afectan a la selección final de la plataforma de genotipado más idónea.

Algunos de los factores determinantes son:

- Tipo de proyecto de genotipado (Whole Genome Scan, Linkage Mapping, Custom SNPs…)

- Nº SNPs y Nº muestras del proyecto.

- Coste y tiempo de ejecución del genotipado.

- Flexibilidad en la selección de SNPs para el genotipado.

- Calidad y cantidad de muestra de ADN disponible.


¿Cúal es el coste de mi proyecto de genotipado?


En cualquier momento puedo solicitar a la Coordinación CeGen un PRESUPUESTO de SERVICIO CeGen.

Los presupuestos CeGen tienen vigencia hasta nuevo cambio oficial de tarifas. 

Ver modelo presupuesto CeGen



Quiero solicitar un Servicio CeGen, ¿Cómo debo proceder?


Una petición de Servicio CEGEN queda formalizada con el documento  SOLICITUD de SERVICIO CeGen

Toda solicitud CeGen debe estar vinculada  a un presupuesto CeGen vigente.
Para formalizar una Solicitud CeGen contactar con la Estructura Central-Coordinación

Ver modelo SOLICITUD CeGen


¿Qué información sobre los SNPs es necesaria para llevar a cabo el prediseño o el genotipado?


En función de la plataforma de genotipado, la información que la plataforma necesita es distinta.

Para tener información detallada, consultar con la sección de la web Cómo Enviar info SNPs a genotipar



¿Cómo debo enviar mis muestras para el genotipado de mi proyecto?


Esta información junto a la dirección y persona de contacto de cada plataforma tecnológica se encuentra en la sección Cómo enviar mis muestras



¿Cómo obtener información sobre las tecnologías de genotipado CeGen?

Cada plataforma tiene un responsable técnico con el que puedes contactar en cualquier momento para obtener información sobre las tecnologías CeGen.


Plataforma Illumina, Veracode y Taqman Madrid: Anna González Neira
Plataforma Sequenom Santiago: María Torres
Plataforma Affymetrix Santiago: Bea Sobrino
Plataforma Illumina, Veracode y SNPlex Barcelona: Magda Monfort



¿Cómo recibiré los resultados de genotipado de mi proyecto?


Los resultados del genotipado (genotipos) son depositados por la plataforma/nodo ejecutor en un “Estudio SNPator* que se crea cuando se formaliza una SOLICITUD DE SERVICIO de genotipado. 

Cuando todos los resultados de un proyecto de genotipado están depositados en su correspondiente estudio, los bioinformáticos CeGen se ponen en contacto con el usuario para facilitarle un "user" y un "password" de acceso a los datos.


Los resultados correspondientes a marcadores tipo in/del por su naturaleza no bialélica no pueden ser depositados en SNPator y serán entregados al usuario directamente por los responsables de plataforma en ficheros tipo Excel o similar.



¿Cómo se realiza la facturación de los servicios CeGen?


Los servicios del CEGEN se facturarán a la institución solicitante directamente desde el nodo ejecutante.


Dado que la naturaleza de los servicios CeGen requieren una inversión en fungibles específicos y exclusivos para cada proyecto, el nodo ejecutante facturará al cliente el 50% de los costes presupuestados por adelantado a partir del momento de la aceptación de la solicitud de servicios. El pago de este 50% marcará la fecha de inicio de la prestación de servicios. El 50% restante se facturará a la entrega de los resultados finales de los servicios solicitados. 


En algunos casos, el nodo ejecutor puede decidir facturar el 100% del servicio de una sola vez a la entrega de los resultados al cliente.

 

     
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